Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH1P12830 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDH1P12830 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH1P12830 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH1P12830 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH1P12830 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDH1P12830 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH1P12830 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH1P12830 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH1P12830 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDH1P12830 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH1P12830 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH1P12830 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDH1P12830 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH1P12830 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH1P12830 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDH1P12830 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH1P12830 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH1P12830 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDH1P12830 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH1P12830 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH1P12830 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDH1P12830 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDH1P12830 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH1P12830 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH1P12830 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CDH1P12830 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CDH1P12830 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH1P12830 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDH1P12830 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH1P12830 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH1P12830 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH1P12830 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH1P12830 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH1P12830 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH1P12830 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDH1P12830 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH1P12830 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH1P12830 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH1P12830 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH1P12830 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDH1P12830 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH1P12830 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CDH1P12830 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH1P12830 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDH1P12830 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH1P12830 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH1P12830 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH1P12830 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH1P12830 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH1P12830 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH1P12830 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH1P12830 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH1P12830 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH1P12830 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH1P12830 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH1P12830 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH1P12830 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH1P12830 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH1P12830 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH1P12830 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH1P12830 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH1P12830 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH1P12830 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH1P12830 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH1P12830 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH1P12830 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH1P12830 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH1P12830 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH1P12830 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH1P12830 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH1P12830 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH1P12830 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH1P12830 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH1P12830 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH1P12830 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH1P12830 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH1P12830 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH1P12830 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH1P12830 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH1P12830 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH1P12830 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH1P12830 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH1P12830 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH1P12830 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH1P12830 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH1P12830 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDH1P12830 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH1P12830 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH1P12830 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CDH1P12830 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH1P12830 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH1P12830 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH1P12830 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH1P12830 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH1P12830 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDH1P12830 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDH1P12830 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH1P12830 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH1P12830 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms