Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
COL6A2P12110 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
COL6A2P12110 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
COL6A2P12110 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
COL6A2P12110 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
COL6A2P12110 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
COL6A2P12110 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms