Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT3P12035 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT3P12035 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KRT3P12035 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT3P12035 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KRT3P12035 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT3P12035 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT3P12035 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KRT3P12035 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT3P12035 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT3P12035 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
KRT3P12035 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KRT3P12035 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT3P12035 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
KRT3P12035 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT3P12035 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT3P12035 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT3P12035 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KRT3P12035 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT3P12035 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT3P12035 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT3P12035 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT3P12035 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
KRT3P12035 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KRT3P12035 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT3P12035 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
KRT3P12035 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT3P12035 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT3P12035 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KRT3P12035 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT3P12035 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KRT3P12035 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT3P12035 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT3P12035 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT3P12035 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.57■■■□□ 2
KRT3P12035 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
KRT3P12035 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KRT3P12035 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KRT3P12035 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
KRT3P12035 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
KRT3P12035 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT3P12035 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT3P12035 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT3P12035 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KRT3P12035 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT3P12035 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT3P12035 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT3P12035 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KRT3P12035 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KRT3P12035 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT3P12035 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
KRT3P12035 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT3P12035 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT3P12035 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT3P12035 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KRT3P12035 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
KRT3P12035 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KRT3P12035 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KRT3P12035 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT3P12035 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT3P12035 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KRT3P12035 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT3P12035 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT3P12035 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT3P12035 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT3P12035 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KRT3P12035 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT3P12035 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT3P12035 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KRT3P12035 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT3P12035 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KRT3P12035 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT3P12035 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT3P12035 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
KRT3P12035 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT3P12035 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT3P12035 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT3P12035 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT3P12035 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KRT3P12035 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT3P12035 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT3P12035 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
KRT3P12035 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT3P12035 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT3P12035 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT3P12035 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT3P12035 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KRT3P12035 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT3P12035 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT3P12035 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KRT3P12035 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
KRT3P12035 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT3P12035 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT3P12035 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KRT3P12035 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT3P12035 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT3P12035 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
KRT3P12035 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KRT3P12035 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KRT3P12035 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms