Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF1P10914 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
IRF1P10914 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF1P10914 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
IRF1P10914 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF1P10914 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF1P10914 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF1P10914 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
IRF1P10914 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF1P10914 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF1P10914 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
IRF1P10914 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
IRF1P10914 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF1P10914 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF1P10914 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF1P10914 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF1P10914 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF1P10914 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF1P10914 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IRF1P10914 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRF1P10914 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
IRF1P10914 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRF1P10914 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IRF1P10914 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF1P10914 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF1P10914 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
IRF1P10914 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRF1P10914 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRF1P10914 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IRF1P10914 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
IRF1P10914 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF1P10914 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
IRF1P10914 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF1P10914 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
IRF1P10914 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF1P10914 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IRF1P10914 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRF1P10914 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
IRF1P10914 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
IRF1P10914 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRF1P10914 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRF1P10914 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRF1P10914 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
IRF1P10914 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF1P10914 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
IRF1P10914 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF1P10914 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF1P10914 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
IRF1P10914 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF1P10914 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
IRF1P10914 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
IRF1P10914 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
IRF1P10914 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF1P10914 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF1P10914 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
IRF1P10914 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
IRF1P10914 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
IRF1P10914 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF1P10914 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF1P10914 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF1P10914 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
IRF1P10914 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF1P10914 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF1P10914 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF1P10914 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
IRF1P10914 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF1P10914 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
IRF1P10914 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF1P10914 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF1P10914 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
IRF1P10914 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF1P10914 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF1P10914 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF1P10914 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
IRF1P10914 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF1P10914 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IRF1P10914 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF1P10914 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF1P10914 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF1P10914 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF1P10914 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF1P10914 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF1P10914 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IRF1P10914 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF1P10914 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF1P10914 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
IRF1P10914 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF1P10914 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF1P10914 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF1P10914 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF1P10914 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF1P10914 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
IRF1P10914 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF1P10914 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF1P10914 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF1P10914 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF1P10914 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF1P10914 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
IRF1P10914 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IRF1P10914 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms