Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HKR1P10072 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HKR1P10072 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HKR1P10072 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
HKR1P10072 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
HKR1P10072 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HKR1P10072 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HKR1P10072 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HKR1P10072 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HKR1P10072 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HKR1P10072 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HKR1P10072 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HKR1P10072 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HKR1P10072 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HKR1P10072 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HKR1P10072 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HKR1P10072 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HKR1P10072 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HKR1P10072 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HKR1P10072 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HKR1P10072 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HKR1P10072 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HKR1P10072 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HKR1P10072 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HKR1P10072 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HKR1P10072 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HKR1P10072 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HKR1P10072 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HKR1P10072 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HKR1P10072 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HKR1P10072 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HKR1P10072 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HKR1P10072 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HKR1P10072 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HKR1P10072 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HKR1P10072 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HKR1P10072 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HKR1P10072 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HKR1P10072 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HKR1P10072 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HKR1P10072 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HKR1P10072 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HKR1P10072 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HKR1P10072 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HKR1P10072 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HKR1P10072 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
HKR1P10072 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
HKR1P10072 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HKR1P10072 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HKR1P10072 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HKR1P10072 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HKR1P10072 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HKR1P10072 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HKR1P10072 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HKR1P10072 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HKR1P10072 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HKR1P10072 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HKR1P10072 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HKR1P10072 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HKR1P10072 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HKR1P10072 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HKR1P10072 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HKR1P10072 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HKR1P10072 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HKR1P10072 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HKR1P10072 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HKR1P10072 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HKR1P10072 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HKR1P10072 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HKR1P10072 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HKR1P10072 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HKR1P10072 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HKR1P10072 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HKR1P10072 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HKR1P10072 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HKR1P10072 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HKR1P10072 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HKR1P10072 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HKR1P10072 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HKR1P10072 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HKR1P10072 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HKR1P10072 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HKR1P10072 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HKR1P10072 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HKR1P10072 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HKR1P10072 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HKR1P10072 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HKR1P10072 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HKR1P10072 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HKR1P10072 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HKR1P10072 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HKR1P10072 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HKR1P10072 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HKR1P10072 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HKR1P10072 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HKR1P10072 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HKR1P10072 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HKR1P10072 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
HKR1P10072 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HKR1P10072 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms