Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SRGAP2CP0DJJ0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SRGAP2CP0DJJ0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SRGAP2CP0DJJ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SRGAP2CP0DJJ0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRGAP2CP0DJJ0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SRGAP2CP0DJJ0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRGAP2CP0DJJ0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms