Protein–RNA interactions for Protein: P08247

SYP, Synaptophysin, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPP08247 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYPP08247 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYPP08247 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYPP08247 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPP08247 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPP08247 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPP08247 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYPP08247 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYPP08247 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYPP08247 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYPP08247 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYPP08247 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYPP08247 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYPP08247 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYPP08247 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYPP08247 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYPP08247 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYPP08247 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYPP08247 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYPP08247 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYPP08247 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYPP08247 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYPP08247 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYPP08247 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYPP08247 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYPP08247 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYPP08247 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYPP08247 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYPP08247 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYPP08247 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYPP08247 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYPP08247 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYPP08247 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYPP08247 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SYPP08247 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SYPP08247 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPP08247 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SYPP08247 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SYPP08247 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SYPP08247 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYPP08247 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SYPP08247 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYPP08247 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SYPP08247 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYPP08247 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYPP08247 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYPP08247 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYPP08247 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SYPP08247 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYPP08247 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SYPP08247 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SYPP08247 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SYPP08247 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYPP08247 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SYPP08247 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYPP08247 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SYPP08247 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYPP08247 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYPP08247 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SYPP08247 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYPP08247 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SYPP08247 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYPP08247 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SYPP08247 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYPP08247 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYPP08247 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SYPP08247 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYPP08247 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYPP08247 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SYPP08247 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYPP08247 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SYPP08247 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SYPP08247 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYPP08247 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYPP08247 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYPP08247 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SYPP08247 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SYPP08247 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SYPP08247 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYPP08247 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SYPP08247 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYPP08247 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYPP08247 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYPP08247 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYPP08247 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SYPP08247 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYPP08247 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SYPP08247 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYPP08247 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SYPP08247 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SYPP08247 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms