Protein–RNA interactions for Protein: P08237

PFKM, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, muscle type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKMP08237 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PFKMP08237 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PFKMP08237 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PFKMP08237 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PFKMP08237 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PFKMP08237 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PFKMP08237 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PFKMP08237 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PFKMP08237 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PFKMP08237 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PFKMP08237 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PFKMP08237 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PFKMP08237 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PFKMP08237 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PFKMP08237 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PFKMP08237 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PFKMP08237 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PFKMP08237 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PFKMP08237 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PFKMP08237 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PFKMP08237 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PFKMP08237 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PFKMP08237 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PFKMP08237 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PFKMP08237 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PFKMP08237 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PFKMP08237 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PFKMP08237 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PFKMP08237 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PFKMP08237 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PFKMP08237 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PFKMP08237 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PFKMP08237 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PFKMP08237 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKMP08237 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKMP08237 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKMP08237 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PFKMP08237 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PFKMP08237 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PFKMP08237 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PFKMP08237 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PFKMP08237 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PFKMP08237 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PFKMP08237 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PFKMP08237 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PFKMP08237 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PFKMP08237 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PFKMP08237 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PFKMP08237 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PFKMP08237 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PFKMP08237 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PFKMP08237 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PFKMP08237 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PFKMP08237 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PFKMP08237 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PFKMP08237 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PFKMP08237 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PFKMP08237 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PFKMP08237 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PFKMP08237 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PFKMP08237 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PFKMP08237 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PFKMP08237 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PFKMP08237 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PFKMP08237 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PFKMP08237 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PFKMP08237 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PFKMP08237 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PFKMP08237 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PFKMP08237 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PFKMP08237 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKMP08237 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKMP08237 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PFKMP08237 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PFKMP08237 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PFKMP08237 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PFKMP08237 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PFKMP08237 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PFKMP08237 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms