Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJB1P08034 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
GJB1P08034 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJB1P08034 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJB1P08034 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJB1P08034 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
GJB1P08034 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJB1P08034 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJB1P08034 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
GJB1P08034 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
GJB1P08034 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJB1P08034 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJB1P08034 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
GJB1P08034 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB1P08034 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB1P08034 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB1P08034 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
GJB1P08034 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJB1P08034 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJB1P08034 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
GJB1P08034 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
GJB1P08034 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
GJB1P08034 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GJB1P08034 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.42
GJB1P08034 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
GJB1P08034 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJB1P08034 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
GJB1P08034 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
GJB1P08034 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
GJB1P08034 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
GJB1P08034 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
GJB1P08034 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJB1P08034 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJB1P08034 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJB1P08034 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
GJB1P08034 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJB1P08034 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJB1P08034 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
GJB1P08034 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJB1P08034 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
GJB1P08034 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJB1P08034 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
GJB1P08034 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB1P08034 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB1P08034 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB1P08034 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB1P08034 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
GJB1P08034 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJB1P08034 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
GJB1P08034 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB1P08034 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
GJB1P08034 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GJB1P08034 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJB1P08034 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
GJB1P08034 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJB1P08034 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJB1P08034 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJB1P08034 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
GJB1P08034 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
GJB1P08034 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
GJB1P08034 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GJB1P08034 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
GJB1P08034 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJB1P08034 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB1P08034 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJB1P08034 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJB1P08034 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJB1P08034 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJB1P08034 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJB1P08034 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJB1P08034 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJB1P08034 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJB1P08034 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJB1P08034 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJB1P08034 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJB1P08034 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJB1P08034 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJB1P08034 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJB1P08034 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJB1P08034 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJB1P08034 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJB1P08034 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJB1P08034 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
GJB1P08034 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJB1P08034 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJB1P08034 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJB1P08034 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJB1P08034 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJB1P08034 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms