Protein–RNA interactions for Protein: P05787

KRT8, Keratin, type II cytoskeletal 8, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT8P05787 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT8P05787 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT8P05787 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT8P05787 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT8P05787 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT8P05787 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT8P05787 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT8P05787 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT8P05787 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT8P05787 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT8P05787 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT8P05787 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT8P05787 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT8P05787 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KRT8P05787 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT8P05787 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT8P05787 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT8P05787 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT8P05787 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KRT8P05787 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
KRT8P05787 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT8P05787 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KRT8P05787 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT8P05787 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT8P05787 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT8P05787 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KRT8P05787 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT8P05787 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT8P05787 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT8P05787 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KRT8P05787 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT8P05787 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT8P05787 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT8P05787 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT8P05787 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KRT8P05787 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT8P05787 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT8P05787 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT8P05787 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT8P05787 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KRT8P05787 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT8P05787 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT8P05787 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT8P05787 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT8P05787 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT8P05787 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT8P05787 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT8P05787 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT8P05787 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT8P05787 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT8P05787 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT8P05787 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT8P05787 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT8P05787 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT8P05787 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT8P05787 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT8P05787 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT8P05787 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT8P05787 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT8P05787 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT8P05787 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT8P05787 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT8P05787 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT8P05787 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT8P05787 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT8P05787 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT8P05787 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT8P05787 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT8P05787 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT8P05787 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT8P05787 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT8P05787 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT8P05787 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT8P05787 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT8P05787 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KRT8P05787 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT8P05787 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT8P05787 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT8P05787 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KRT8P05787 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT8P05787 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT8P05787 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KRT8P05787 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT8P05787 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT8P05787 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT8P05787 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT8P05787 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KRT8P05787 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT8P05787 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KRT8P05787 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KRT8P05787 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT8P05787 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT8P05787 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT8P05787 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KRT8P05787 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT8P05787 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT8P05787 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT8P05787 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRT8P05787 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KRT8P05787 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms