Protein–RNA interactions for Protein: P05538

HLA-DQB2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB2P05538 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HLA-DQB2P05538 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
HLA-DQB2P05538 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HLA-DQB2P05538 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HLA-DQB2P05538 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
HLA-DQB2P05538 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HLA-DQB2P05538 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
HLA-DQB2P05538 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DQB2P05538 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
HLA-DQB2P05538 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-DQB2P05538 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-DQB2P05538 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HLA-DQB2P05538 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms