Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP1B1P05026 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP1B1P05026 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATP1B1P05026 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP1B1P05026 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP1B1P05026 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP1B1P05026 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms