Protein–RNA interactions for Protein: P04435

TCRB, T-cell receptor beta chain V region CTL-L17, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCRBP04435 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBP04435 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCRBP04435 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBP04435 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBP04435 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCRBP04435 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBP04435 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCRBP04435 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBP04435 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCRBP04435 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBP04435 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBP04435 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBP04435 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBP04435 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBP04435 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCRBP04435 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TCRBP04435 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBP04435 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBP04435 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBP04435 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TCRBP04435 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TCRBP04435 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBP04435 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBP04435 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBP04435 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TCRBP04435 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBP04435 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBP04435 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBP04435 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TCRBP04435 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBP04435 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TCRBP04435 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBP04435 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBP04435 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBP04435 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBP04435 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TCRBP04435 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBP04435 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBP04435 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TCRBP04435 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TCRBP04435 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBP04435 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBP04435 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBP04435 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TCRBP04435 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBP04435 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBP04435 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TCRBP04435 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBP04435 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TCRBP04435 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBP04435 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBP04435 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBP04435 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBP04435 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBP04435 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBP04435 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TCRBP04435 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBP04435 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBP04435 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBP04435 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TCRBP04435 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBP04435 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBP04435 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBP04435 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TCRBP04435 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBP04435 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TCRBP04435 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBP04435 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TCRBP04435 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBP04435 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBP04435 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBP04435 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TCRBP04435 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBP04435 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBP04435 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBP04435 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBP04435 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBP04435 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TCRBP04435 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBP04435 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TCRBP04435 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBP04435 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBP04435 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCRBP04435 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBP04435 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBP04435 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBP04435 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCRBP04435 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBP04435 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBP04435 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCRBP04435 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCRBP04435 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCRBP04435 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBP04435 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBP04435 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBP04435 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBP04435 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCRBP04435 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCRBP04435 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCRBP04435 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms