Protein–RNA interactions for Protein: P04233

CD74, HLA class II histocompatibility antigen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD74P04233 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD74P04233 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD74P04233 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD74P04233 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD74P04233 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD74P04233 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD74P04233 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD74P04233 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD74P04233 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CD74P04233 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD74P04233 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD74P04233 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD74P04233 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD74P04233 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD74P04233 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD74P04233 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD74P04233 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD74P04233 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD74P04233 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD74P04233 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD74P04233 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD74P04233 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD74P04233 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD74P04233 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD74P04233 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD74P04233 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD74P04233 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD74P04233 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD74P04233 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD74P04233 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD74P04233 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD74P04233 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD74P04233 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD74P04233 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD74P04233 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD74P04233 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD74P04233 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD74P04233 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD74P04233 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD74P04233 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD74P04233 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD74P04233 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CD74P04233 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD74P04233 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD74P04233 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD74P04233 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD74P04233 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD74P04233 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD74P04233 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD74P04233 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD74P04233 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD74P04233 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD74P04233 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD74P04233 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD74P04233 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD74P04233 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD74P04233 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD74P04233 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD74P04233 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD74P04233 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CD74P04233 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD74P04233 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD74P04233 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD74P04233 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD74P04233 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD74P04233 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD74P04233 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD74P04233 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CD74P04233 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD74P04233 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD74P04233 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD74P04233 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD74P04233 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD74P04233 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD74P04233 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD74P04233 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD74P04233 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD74P04233 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD74P04233 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD74P04233 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD74P04233 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD74P04233 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD74P04233 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD74P04233 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD74P04233 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD74P04233 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD74P04233 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD74P04233 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD74P04233 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD74P04233 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CD74P04233 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD74P04233 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD74P04233 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CD74P04233 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD74P04233 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD74P04233 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD74P04233 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD74P04233 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD74P04233 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD74P04233 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms