Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOD2P04179 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SOD2P04179 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOD2P04179 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOD2P04179 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOD2P04179 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SOD2P04179 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOD2P04179 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOD2P04179 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOD2P04179 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOD2P04179 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOD2P04179 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SOD2P04179 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOD2P04179 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOD2P04179 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SOD2P04179 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOD2P04179 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOD2P04179 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOD2P04179 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOD2P04179 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOD2P04179 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOD2P04179 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOD2P04179 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOD2P04179 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOD2P04179 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SOD2P04179 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SOD2P04179 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOD2P04179 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOD2P04179 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOD2P04179 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOD2P04179 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SOD2P04179 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SOD2P04179 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SOD2P04179 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOD2P04179 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOD2P04179 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOD2P04179 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SOD2P04179 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOD2P04179 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOD2P04179 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOD2P04179 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOD2P04179 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOD2P04179 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOD2P04179 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SOD2P04179 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOD2P04179 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SOD2P04179 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOD2P04179 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOD2P04179 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOD2P04179 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOD2P04179 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOD2P04179 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOD2P04179 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SOD2P04179 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOD2P04179 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOD2P04179 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SOD2P04179 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOD2P04179 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SOD2P04179 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SOD2P04179 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOD2P04179 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOD2P04179 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SOD2P04179 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOD2P04179 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOD2P04179 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOD2P04179 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SOD2P04179 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOD2P04179 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOD2P04179 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOD2P04179 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SOD2P04179 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SOD2P04179 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOD2P04179 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SOD2P04179 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SOD2P04179 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SOD2P04179 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SOD2P04179 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOD2P04179 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SOD2P04179 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SOD2P04179 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOD2P04179 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SOD2P04179 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOD2P04179 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SOD2P04179 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOD2P04179 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOD2P04179 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOD2P04179 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SOD2P04179 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms