Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC3P02656 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC3P02656 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
APOC3P02656 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
APOC3P02656 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC3P02656 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC3P02656 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC3P02656 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
APOC3P02656 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC3P02656 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC3P02656 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
APOC3P02656 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC3P02656 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC3P02656 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
APOC3P02656 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC3P02656 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC3P02656 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC3P02656 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
APOC3P02656 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC3P02656 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC3P02656 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
APOC3P02656 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC3P02656 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC3P02656 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC3P02656 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
APOC3P02656 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC3P02656 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC3P02656 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC3P02656 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC3P02656 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
APOC3P02656 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
APOC3P02656 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC3P02656 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
APOC3P02656 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
APOC3P02656 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
APOC3P02656 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC3P02656 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
APOC3P02656 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC3P02656 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOC3P02656 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
APOC3P02656 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOC3P02656 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOC3P02656 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOC3P02656 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOC3P02656 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC3P02656 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC3P02656 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOC3P02656 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC3P02656 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC3P02656 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC3P02656 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
APOC3P02656 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC3P02656 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC3P02656 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC3P02656 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC3P02656 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC3P02656 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC3P02656 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC3P02656 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOC3P02656 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC3P02656 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC3P02656 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC3P02656 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC3P02656 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOC3P02656 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
APOC3P02656 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
APOC3P02656 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC3P02656 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
APOC3P02656 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC3P02656 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC3P02656 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC3P02656 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
APOC3P02656 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC3P02656 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC3P02656 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC3P02656 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
APOC3P02656 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC3P02656 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
APOC3P02656 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC3P02656 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC3P02656 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC3P02656 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC3P02656 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC3P02656 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
APOC3P02656 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
APOC3P02656 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC3P02656 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC3P02656 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
APOC3P02656 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC3P02656 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC3P02656 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
APOC3P02656 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms