Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNA21P01568 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
IFNA21P01568 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IFNA21P01568 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
IFNA21P01568 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFNA21P01568 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms