Protein–RNA interactions for Protein: P01189

POMC, Pro-opiomelanocortin, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMCP01189 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POMCP01189 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POMCP01189 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POMCP01189 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POMCP01189 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POMCP01189 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POMCP01189 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POMCP01189 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POMCP01189 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
POMCP01189 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POMCP01189 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POMCP01189 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POMCP01189 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POMCP01189 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POMCP01189 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
POMCP01189 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POMCP01189 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POMCP01189 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POMCP01189 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POMCP01189 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
POMCP01189 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POMCP01189 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POMCP01189 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
POMCP01189 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
POMCP01189 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
POMCP01189 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
POMCP01189 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
POMCP01189 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
POMCP01189 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
POMCP01189 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
POMCP01189 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
POMCP01189 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POMCP01189 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
POMCP01189 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
POMCP01189 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POMCP01189 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
POMCP01189 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POMCP01189 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
POMCP01189 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
POMCP01189 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
POMCP01189 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
POMCP01189 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
POMCP01189 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
POMCP01189 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POMCP01189 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
POMCP01189 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POMCP01189 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POMCP01189 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POMCP01189 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POMCP01189 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POMCP01189 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POMCP01189 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POMCP01189 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POMCP01189 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POMCP01189 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POMCP01189 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POMCP01189 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POMCP01189 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POMCP01189 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POMCP01189 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POMCP01189 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POMCP01189 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
POMCP01189 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POMCP01189 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POMCP01189 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POMCP01189 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POMCP01189 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
POMCP01189 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POMCP01189 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POMCP01189 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POMCP01189 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POMCP01189 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
POMCP01189 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
POMCP01189 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POMCP01189 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POMCP01189 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POMCP01189 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POMCP01189 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POMCP01189 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POMCP01189 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POMCP01189 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POMCP01189 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POMCP01189 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POMCP01189 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POMCP01189 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POMCP01189 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POMCP01189 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POMCP01189 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
POMCP01189 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POMCP01189 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms