Protein–RNA interactions for Protein: P00480

OTC, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTCP00480 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTCP00480 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTCP00480 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTCP00480 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
OTCP00480 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTCP00480 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTCP00480 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTCP00480 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
OTCP00480 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTCP00480 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTCP00480 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTCP00480 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTCP00480 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTCP00480 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
OTCP00480 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OTCP00480 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
OTCP00480 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTCP00480 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTCP00480 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
OTCP00480 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
OTCP00480 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
OTCP00480 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTCP00480 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
OTCP00480 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTCP00480 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTCP00480 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
OTCP00480 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTCP00480 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTCP00480 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
OTCP00480 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTCP00480 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTCP00480 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTCP00480 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTCP00480 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTCP00480 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
OTCP00480 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
OTCP00480 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTCP00480 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
OTCP00480 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTCP00480 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTCP00480 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTCP00480 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
OTCP00480 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTCP00480 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
OTCP00480 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTCP00480 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
OTCP00480 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTCP00480 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
OTCP00480 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTCP00480 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTCP00480 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
OTCP00480 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTCP00480 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTCP00480 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
OTCP00480 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTCP00480 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTCP00480 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTCP00480 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
OTCP00480 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTCP00480 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
OTCP00480 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
OTCP00480 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
OTCP00480 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTCP00480 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTCP00480 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
OTCP00480 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
OTCP00480 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTCP00480 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTCP00480 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTCP00480 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OTCP00480 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTCP00480 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTCP00480 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTCP00480 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OTCP00480 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTCP00480 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTCP00480 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTCP00480 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OTCP00480 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTCP00480 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTCP00480 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTCP00480 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OTCP00480 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTCP00480 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OTCP00480 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTCP00480 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTCP00480 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTCP00480 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTCP00480 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTCP00480 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OTCP00480 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTCP00480 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTCP00480 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OTCP00480 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTCP00480 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTCP00480 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTCP00480 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OTCP00480 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OTCP00480 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
OTCP00480 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms