Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACTL6AO96019 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTL6AO96019 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ACTL6AO96019 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ACTL6AO96019 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTL6AO96019 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ACTL6AO96019 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ACTL6AO96019 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms