Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ATG7O95352 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ATG7O95352 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG7O95352 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG7O95352 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG7O95352 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG7O95352 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ATG7O95352 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG7O95352 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG7O95352 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ATG7O95352 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG7O95352 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ATG7O95352 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG7O95352 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ATG7O95352 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ATG7O95352 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ATG7O95352 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ATG7O95352 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG7O95352 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ATG7O95352 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG7O95352 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG7O95352 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG7O95352 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ATG7O95352 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ATG7O95352 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG7O95352 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ATG7O95352 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG7O95352 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG7O95352 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG7O95352 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG7O95352 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ATG7O95352 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG7O95352 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ATG7O95352 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ATG7O95352 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG7O95352 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ATG7O95352 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ATG7O95352 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG7O95352 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG7O95352 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ATG7O95352 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ATG7O95352 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ATG7O95352 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
ATG7O95352 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG7O95352 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ATG7O95352 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATG7O95352 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATG7O95352 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ATG7O95352 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG7O95352 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ATG7O95352 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG7O95352 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG7O95352 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ATG7O95352 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ATG7O95352 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ATG7O95352 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ATG7O95352 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG7O95352 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ATG7O95352 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ATG7O95352 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ATG7O95352 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG7O95352 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG7O95352 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG7O95352 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG7O95352 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ATG7O95352 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG7O95352 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
ATG7O95352 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG7O95352 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG7O95352 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG7O95352 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG7O95352 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ATG7O95352 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG7O95352 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG7O95352 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
ATG7O95352 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG7O95352 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
ATG7O95352 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ATG7O95352 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ATG7O95352 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATG7O95352 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ATG7O95352 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG7O95352 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG7O95352 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ATG7O95352 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG7O95352 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ATG7O95352 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG7O95352 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG7O95352 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG7O95352 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ATG7O95352 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ATG7O95352 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms