Protein–RNA interactions for Protein: O95263

PDE8B, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, humanhuman

Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8BO95263 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
PDE8BO95263 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PDE8BO95263 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PDE8BO95263 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
PDE8BO95263 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
PDE8BO95263 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PDE8BO95263 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
PDE8BO95263 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PDE8BO95263 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PDE8BO95263 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms