Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
UBXN7O94888 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
UBXN7O94888 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
UBXN7O94888 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBXN7O94888 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBXN7O94888 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBXN7O94888 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBXN7O94888 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms