Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RASSF9O75901 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RASSF9O75901 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RASSF9O75901 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RASSF9O75901 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
RASSF9O75901 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RASSF9O75901 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms