Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
STX11O75558 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
STX11O75558 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX11O75558 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
STX11O75558 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX11O75558 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
STX11O75558 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX11O75558 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
STX11O75558 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX11O75558 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
STX11O75558 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX11O75558 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX11O75558 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
STX11O75558 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX11O75558 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX11O75558 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
STX11O75558 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX11O75558 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX11O75558 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
STX11O75558 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX11O75558 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
STX11O75558 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
STX11O75558 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
STX11O75558 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX11O75558 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX11O75558 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX11O75558 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
STX11O75558 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX11O75558 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX11O75558 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX11O75558 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
STX11O75558 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX11O75558 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX11O75558 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
STX11O75558 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX11O75558 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX11O75558 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX11O75558 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX11O75558 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
STX11O75558 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX11O75558 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
STX11O75558 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
STX11O75558 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
STX11O75558 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX11O75558 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX11O75558 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX11O75558 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
STX11O75558 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX11O75558 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX11O75558 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX11O75558 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STX11O75558 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX11O75558 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX11O75558 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX11O75558 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STX11O75558 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX11O75558 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX11O75558 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STX11O75558 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX11O75558 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX11O75558 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STX11O75558 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX11O75558 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX11O75558 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX11O75558 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STX11O75558 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX11O75558 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX11O75558 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STX11O75558 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STX11O75558 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX11O75558 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX11O75558 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STX11O75558 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX11O75558 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX11O75558 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX11O75558 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX11O75558 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STX11O75558 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX11O75558 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STX11O75558 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STX11O75558 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX11O75558 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
STX11O75558 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX11O75558 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
STX11O75558 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
STX11O75558 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
STX11O75558 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX11O75558 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX11O75558 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX11O75558 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX11O75558 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
STX11O75558 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX11O75558 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX11O75558 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX11O75558 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX11O75558 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX11O75558 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX11O75558 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
STX11O75558 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
STX11O75558 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms