Protein–RNA interactions for Protein: O75437

ZNF254, Zinc finger protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF254O75437 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF254O75437 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF254O75437 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF254O75437 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ZNF254O75437 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF254O75437 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms