Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ULK1O75385 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ULK1O75385 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ULK1O75385 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ULK1O75385 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ULK1O75385 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ULK1O75385 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ULK1O75385 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ULK1O75385 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ULK1O75385 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK1O75385 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK1O75385 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK1O75385 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK1O75385 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK1O75385 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK1O75385 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK1O75385 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ULK1O75385 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK1O75385 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK1O75385 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK1O75385 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK1O75385 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK1O75385 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK1O75385 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ULK1O75385 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK1O75385 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK1O75385 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ULK1O75385 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK1O75385 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK1O75385 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK1O75385 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK1O75385 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK1O75385 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ULK1O75385 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ULK1O75385 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ULK1O75385 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ULK1O75385 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK1O75385 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ULK1O75385 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK1O75385 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK1O75385 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK1O75385 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ULK1O75385 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ULK1O75385 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ULK1O75385 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ULK1O75385 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ULK1O75385 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ULK1O75385 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ULK1O75385 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ULK1O75385 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ULK1O75385 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ULK1O75385 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ULK1O75385 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ULK1O75385 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ULK1O75385 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ULK1O75385 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ULK1O75385 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ULK1O75385 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ULK1O75385 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ULK1O75385 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ULK1O75385 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ULK1O75385 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ULK1O75385 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ULK1O75385 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK1O75385 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK1O75385 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ULK1O75385 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ULK1O75385 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ULK1O75385 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ULK1O75385 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ULK1O75385 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ULK1O75385 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ULK1O75385 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ULK1O75385 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ULK1O75385 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ULK1O75385 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
ULK1O75385 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK1O75385 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK1O75385 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK1O75385 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ULK1O75385 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ULK1O75385 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ULK1O75385 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ULK1O75385 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ULK1O75385 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK1O75385 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK1O75385 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK1O75385 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ULK1O75385 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ULK1O75385 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ULK1O75385 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ULK1O75385 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms