Protein–RNA interactions for Protein: O75340

PDCD6, Programmed cell death protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6O75340 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PDCD6O75340 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PDCD6O75340 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDCD6O75340 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDCD6O75340 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PDCD6O75340 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms