Protein–RNA interactions for Protein: O75309

CDH16, Cadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH16O75309 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH16O75309 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH16O75309 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CDH16O75309 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH16O75309 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH16O75309 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CDH16O75309 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH16O75309 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH16O75309 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH16O75309 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CDH16O75309 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH16O75309 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH16O75309 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH16O75309 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CDH16O75309 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CDH16O75309 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH16O75309 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH16O75309 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH16O75309 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH16O75309 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CDH16O75309 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CDH16O75309 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH16O75309 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH16O75309 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH16O75309 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CDH16O75309 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CDH16O75309 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH16O75309 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH16O75309 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH16O75309 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CDH16O75309 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH16O75309 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH16O75309 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH16O75309 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CDH16O75309 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH16O75309 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH16O75309 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH16O75309 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CDH16O75309 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH16O75309 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH16O75309 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CDH16O75309 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH16O75309 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH16O75309 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CDH16O75309 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH16O75309 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH16O75309 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CDH16O75309 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH16O75309 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CDH16O75309 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH16O75309 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CDH16O75309 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH16O75309 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH16O75309 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH16O75309 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH16O75309 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH16O75309 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CDH16O75309 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH16O75309 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH16O75309 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CDH16O75309 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CDH16O75309 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH16O75309 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH16O75309 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CDH16O75309 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH16O75309 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH16O75309 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CDH16O75309 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH16O75309 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH16O75309 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CDH16O75309 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH16O75309 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH16O75309 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH16O75309 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH16O75309 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CDH16O75309 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH16O75309 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH16O75309 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CDH16O75309 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH16O75309 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH16O75309 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CDH16O75309 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH16O75309 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH16O75309 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH16O75309 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH16O75309 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CDH16O75309 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH16O75309 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH16O75309 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH16O75309 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CDH16O75309 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CDH16O75309 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH16O75309 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH16O75309 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CDH16O75309 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH16O75309 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH16O75309 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH16O75309 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH16O75309 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CDH16O75309 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms