Protein–RNA interactions for Protein: O60902

SHOX2, Short stature homeobox protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOX2O60902 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SHOX2O60902 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SHOX2O60902 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SHOX2O60902 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SHOX2O60902 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SHOX2O60902 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SHOX2O60902 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SHOX2O60902 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOX2O60902 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOX2O60902 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SHOX2O60902 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms