Protein–RNA interactions for Protein: O60831

PRAF2, PRA1 family protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAF2O60831 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAF2O60831 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAF2O60831 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAF2O60831 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAF2O60831 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRAF2O60831 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRAF2O60831 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms