Protein–RNA interactions for Protein: O60732

MAGEC1, Melanoma-associated antigen C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEC1O60732 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MAGEC1O60732 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
MAGEC1O60732 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MAGEC1O60732 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MAGEC1O60732 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
MAGEC1O60732 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
MAGEC1O60732 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEC1O60732 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEC1O60732 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEC1O60732 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MAGEC1O60732 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEC1O60732 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MAGEC1O60732 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms