Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NOBOXO60393 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NOBOXO60393 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NOBOXO60393 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
NOBOXO60393 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NOBOXO60393 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NOBOXO60393 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NOBOXO60393 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms