Protein–RNA interactions for Protein: O60313

OPA1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA1O60313 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OPA1O60313 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OPA1O60313 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
OPA1O60313 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
OPA1O60313 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPA1O60313 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPA1O60313 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPA1O60313 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPA1O60313 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
OPA1O60313 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
OPA1O60313 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
OPA1O60313 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OPA1O60313 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OPA1O60313 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OPA1O60313 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPA1O60313 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OPA1O60313 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPA1O60313 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OPA1O60313 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OPA1O60313 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
OPA1O60313 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OPA1O60313 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OPA1O60313 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OPA1O60313 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OPA1O60313 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OPA1O60313 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPA1O60313 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPA1O60313 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPA1O60313 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPA1O60313 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OPA1O60313 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OPA1O60313 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OPA1O60313 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
OPA1O60313 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OPA1O60313 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OPA1O60313 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OPA1O60313 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
OPA1O60313 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OPA1O60313 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OPA1O60313 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
OPA1O60313 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPA1O60313 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPA1O60313 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OPA1O60313 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
OPA1O60313 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OPA1O60313 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPA1O60313 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPA1O60313 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPA1O60313 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OPA1O60313 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPA1O60313 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPA1O60313 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OPA1O60313 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OPA1O60313 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OPA1O60313 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OPA1O60313 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OPA1O60313 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
OPA1O60313 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
OPA1O60313 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPA1O60313 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPA1O60313 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OPA1O60313 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OPA1O60313 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OPA1O60313 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OPA1O60313 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OPA1O60313 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OPA1O60313 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
OPA1O60313 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
OPA1O60313 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
OPA1O60313 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
OPA1O60313 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
OPA1O60313 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPA1O60313 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPA1O60313 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPA1O60313 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPA1O60313 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
OPA1O60313 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OPA1O60313 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPA1O60313 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OPA1O60313 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
OPA1O60313 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPA1O60313 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
OPA1O60313 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPA1O60313 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OPA1O60313 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPA1O60313 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPA1O60313 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPA1O60313 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
OPA1O60313 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPA1O60313 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPA1O60313 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPA1O60313 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OPA1O60313 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OPA1O60313 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OPA1O60313 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
OPA1O60313 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPA1O60313 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPA1O60313 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OPA1O60313 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
OPA1O60313 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms