Protein–RNA interactions for Protein: O60238

BNIP3L, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3LO60238 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
BNIP3LO60238 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
BNIP3LO60238 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BNIP3LO60238 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BNIP3LO60238 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BNIP3LO60238 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
BNIP3LO60238 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BNIP3LO60238 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BNIP3LO60238 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BNIP3LO60238 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BNIP3LO60238 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BNIP3LO60238 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BNIP3LO60238 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BNIP3LO60238 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.7 ms