Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
SLC25A20O43772 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC25A20O43772 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC25A20O43772 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SLC25A20O43772 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SLC25A20O43772 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms