Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SYNGR2O43760 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SYNGR2O43760 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SYNGR2O43760 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SYNGR2O43760 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SYNGR2O43760 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms