Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
DCXO43602 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DCXO43602 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DCXO43602 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCXO43602 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCXO43602 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
DCXO43602 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCXO43602 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DCXO43602 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCXO43602 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DCXO43602 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DCXO43602 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DCXO43602 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCXO43602 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DCXO43602 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DCXO43602 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DCXO43602 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
DCXO43602 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCXO43602 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCXO43602 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DCXO43602 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCXO43602 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DCXO43602 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCXO43602 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCXO43602 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DCXO43602 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCXO43602 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCXO43602 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCXO43602 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DCXO43602 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DCXO43602 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DCXO43602 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCXO43602 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCXO43602 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DCXO43602 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DCXO43602 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCXO43602 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCXO43602 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCXO43602 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DCXO43602 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCXO43602 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCXO43602 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DCXO43602 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCXO43602 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCXO43602 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DCXO43602 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCXO43602 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCXO43602 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCXO43602 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCXO43602 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DCXO43602 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCXO43602 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DCXO43602 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DCXO43602 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DCXO43602 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCXO43602 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DCXO43602 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCXO43602 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DCXO43602 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCXO43602 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DCXO43602 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DCXO43602 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCXO43602 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCXO43602 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DCXO43602 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCXO43602 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCXO43602 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DCXO43602 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DCXO43602 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DCXO43602 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCXO43602 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCXO43602 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DCXO43602 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCXO43602 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DCXO43602 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DCXO43602 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DCXO43602 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
DCXO43602 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DCXO43602 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCXO43602 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DCXO43602 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms