Protein–RNA interactions for Protein: O43502

RAD51C, DNA repair protein RAD51 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51CO43502 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RAD51CO43502 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
RAD51CO43502 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RAD51CO43502 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RAD51CO43502 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RAD51CO43502 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RAD51CO43502 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RAD51CO43502 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD51CO43502 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RAD51CO43502 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RAD51CO43502 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms