Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTIFO43310 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTIFO43310 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTIFO43310 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTIFO43310 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTIFO43310 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTIFO43310 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CTIFO43310 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTIFO43310 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTIFO43310 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTIFO43310 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTIFO43310 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTIFO43310 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTIFO43310 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CTIFO43310 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTIFO43310 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTIFO43310 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTIFO43310 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTIFO43310 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTIFO43310 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTIFO43310 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTIFO43310 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTIFO43310 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTIFO43310 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTIFO43310 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTIFO43310 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTIFO43310 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTIFO43310 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTIFO43310 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTIFO43310 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTIFO43310 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CTIFO43310 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CTIFO43310 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTIFO43310 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTIFO43310 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTIFO43310 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTIFO43310 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CTIFO43310 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTIFO43310 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTIFO43310 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CTIFO43310 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CTIFO43310 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTIFO43310 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTIFO43310 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTIFO43310 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTIFO43310 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTIFO43310 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTIFO43310 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTIFO43310 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTIFO43310 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTIFO43310 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTIFO43310 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTIFO43310 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CTIFO43310 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTIFO43310 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTIFO43310 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CTIFO43310 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTIFO43310 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTIFO43310 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTIFO43310 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTIFO43310 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTIFO43310 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTIFO43310 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CTIFO43310 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CTIFO43310 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CTIFO43310 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTIFO43310 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTIFO43310 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTIFO43310 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTIFO43310 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTIFO43310 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CTIFO43310 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTIFO43310 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTIFO43310 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CTIFO43310 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTIFO43310 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTIFO43310 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTIFO43310 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTIFO43310 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTIFO43310 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTIFO43310 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTIFO43310 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTIFO43310 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTIFO43310 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CTIFO43310 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTIFO43310 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTIFO43310 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CTIFO43310 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTIFO43310 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CTIFO43310 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CTIFO43310 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTIFO43310 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTIFO43310 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTIFO43310 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CTIFO43310 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTIFO43310 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTIFO43310 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTIFO43310 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTIFO43310 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTIFO43310 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
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