Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCP110O43303 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCP110O43303 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCP110O43303 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCP110O43303 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCP110O43303 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCP110O43303 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCP110O43303 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCP110O43303 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCP110O43303 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCP110O43303 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCP110O43303 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCP110O43303 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCP110O43303 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCP110O43303 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCP110O43303 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCP110O43303 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCP110O43303 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCP110O43303 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCP110O43303 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCP110O43303 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCP110O43303 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCP110O43303 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCP110O43303 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCP110O43303 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCP110O43303 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCP110O43303 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCP110O43303 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCP110O43303 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCP110O43303 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCP110O43303 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCP110O43303 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCP110O43303 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CCP110O43303 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCP110O43303 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCP110O43303 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCP110O43303 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCP110O43303 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCP110O43303 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCP110O43303 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCP110O43303 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCP110O43303 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCP110O43303 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCP110O43303 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCP110O43303 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCP110O43303 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CCP110O43303 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCP110O43303 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCP110O43303 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CCP110O43303 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCP110O43303 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CCP110O43303 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCP110O43303 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCP110O43303 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCP110O43303 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCP110O43303 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCP110O43303 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCP110O43303 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCP110O43303 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CCP110O43303 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CCP110O43303 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CCP110O43303 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCP110O43303 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CCP110O43303 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCP110O43303 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CCP110O43303 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CCP110O43303 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCP110O43303 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCP110O43303 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCP110O43303 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCP110O43303 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCP110O43303 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCP110O43303 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCP110O43303 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCP110O43303 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCP110O43303 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCP110O43303 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCP110O43303 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCP110O43303 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCP110O43303 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CCP110O43303 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCP110O43303 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCP110O43303 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCP110O43303 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCP110O43303 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCP110O43303 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCP110O43303 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCP110O43303 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCP110O43303 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCP110O43303 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCP110O43303 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCP110O43303 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCP110O43303 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCP110O43303 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCP110O43303 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCP110O43303 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCP110O43303 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCP110O43303 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCP110O43303 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCP110O43303 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms