Protein–RNA interactions for Protein: O15085

ARHGEF11, Rho guanine nucleotide exchange factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF11O15085 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
ARHGEF11O15085 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
ARHGEF11O15085 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
ARHGEF11O15085 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC44■■■■■ 4.63
ARHGEF11O15085 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44■■■■■ 4.63
ARHGEF11O15085 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
ARHGEF11O15085 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
ARHGEF11O15085 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.95■■■■■ 4.63
ARHGEF11O15085 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.63
ARHGEF11O15085 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
ARHGEF11O15085 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC43.88■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
ARHGEF11O15085 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.8■■■■■ 4.6
ARHGEF11O15085 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
ARHGEF11O15085 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC43.79■■■■■ 4.6
ARHGEF11O15085 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
ARHGEF11O15085 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
ARHGEF11O15085 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
ARHGEF11O15085 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.74■■■■■ 4.59
ARHGEF11O15085 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
ARHGEF11O15085 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
ARHGEF11O15085 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
ARHGEF11O15085 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
ARHGEF11O15085 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC43.67■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
ARHGEF11O15085 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC43.6■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
ARHGEF11O15085 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC43.54■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
ARHGEF11O15085 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC43.5■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC43.47■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC43.45■■■■■ 4.55
ARHGEF11O15085 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC43.44■■■■■ 4.54
ARHGEF11O15085 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ARHGEF11O15085 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ARHGEF11O15085 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ARHGEF11O15085 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ARHGEF11O15085 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
ARHGEF11O15085 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
ARHGEF11O15085 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
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