Protein–RNA interactions for Protein: O14796

SH2D1B, SH2 domain-containing protein 1B, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D1BO14796 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SH2D1BO14796 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH2D1BO14796 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SH2D1BO14796 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SH2D1BO14796 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SH2D1BO14796 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms