Protein–RNA interactions for Protein: O14618

CCS, Copper chaperone for superoxide dismutase, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSO14618 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCSO14618 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSO14618 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSO14618 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSO14618 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCSO14618 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSO14618 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSO14618 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCSO14618 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSO14618 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSO14618 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCSO14618 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSO14618 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSO14618 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCSO14618 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSO14618 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCSO14618 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCSO14618 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCSO14618 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCSO14618 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSO14618 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSO14618 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSO14618 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSO14618 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSO14618 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSO14618 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCSO14618 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSO14618 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSO14618 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCSO14618 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSO14618 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSO14618 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSO14618 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSO14618 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCSO14618 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSO14618 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSO14618 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSO14618 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSO14618 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCSO14618 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSO14618 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCSO14618 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSO14618 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSO14618 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSO14618 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCSO14618 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSO14618 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSO14618 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSO14618 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSO14618 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCSO14618 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSO14618 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSO14618 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSO14618 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSO14618 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCSO14618 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSO14618 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCSO14618 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSO14618 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCSO14618 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSO14618 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSO14618 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCSO14618 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSO14618 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCSO14618 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSO14618 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSO14618 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCSO14618 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSO14618 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCSO14618 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCSO14618 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSO14618 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCSO14618 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSO14618 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSO14618 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSO14618 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCSO14618 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCSO14618 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSO14618 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSO14618 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSO14618 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCSO14618 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSO14618 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSO14618 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCSO14618 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSO14618 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSO14618 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCSO14618 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSO14618 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCSO14618 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCSO14618 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSO14618 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCSO14618 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCSO14618 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSO14618 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSO14618 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSO14618 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSO14618 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSO14618 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCSO14618 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms