Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.72■■■■■ 5.07
CUX2O14529 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CUX2O14529 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CUX2O14529 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
CUX2O14529 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CUX2O14529 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.69■■■■■ 5.07
CUX2O14529 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
CUX2O14529 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CUX2O14529 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CUX2O14529 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
CUX2O14529 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
CUX2O14529 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CUX2O14529 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC46.65■■■■■ 5.06
CUX2O14529 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
CUX2O14529 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
CUX2O14529 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.05
CUX2O14529 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
CUX2O14529 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC46.61■■■■■ 5.05
CUX2O14529 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
CUX2O14529 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
CUX2O14529 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
CUX2O14529 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
CUX2O14529 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC46.57■■■■■ 5.05
CUX2O14529 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
CUX2O14529 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
CUX2O14529 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC46.55■■■■■ 5.04
CUX2O14529 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.54■■■■■ 5.04
CUX2O14529 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.53■■■■■ 5.04
CUX2O14529 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
CUX2O14529 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
CUX2O14529 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CUX2O14529 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
CUX2O14529 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CUX2O14529 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
CUX2O14529 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
CUX2O14529 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
CUX2O14529 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.46■■■■■ 5.03
CUX2O14529 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
CUX2O14529 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
CUX2O14529 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
CUX2O14529 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CUX2O14529 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
CUX2O14529 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
CUX2O14529 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC46.38■■■■■ 5.02
CUX2O14529 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC46.38■■■■■ 5.01
CUX2O14529 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.01
CUX2O14529 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
CUX2O14529 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
CUX2O14529 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
CUX2O14529 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
CUX2O14529 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
CUX2O14529 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
CUX2O14529 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
CUX2O14529 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CUX2O14529 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC46.27■■■■■ 5
CUX2O14529 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
CUX2O14529 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
CUX2O14529 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
CUX2O14529 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC46.26■■■■■ 5
CUX2O14529 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC46.26■■■■■ 5
CUX2O14529 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.24■■■■■ 4.99
CUX2O14529 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CUX2O14529 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC46.23■■■■■ 4.99
CUX2O14529 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
CUX2O14529 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CUX2O14529 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
CUX2O14529 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CUX2O14529 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
CUX2O14529 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
CUX2O14529 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC46.2■■■■■ 4.99
CUX2O14529 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
CUX2O14529 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.98
CUX2O14529 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CUX2O14529 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
CUX2O14529 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
CUX2O14529 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC46.17■■■■■ 4.98
CUX2O14529 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC46.16■■■■■ 4.98
CUX2O14529 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
CUX2O14529 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.98
CUX2O14529 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
CUX2O14529 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
CUX2O14529 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
CUX2O14529 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
CUX2O14529 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC46.09■■■■■ 4.97
CUX2O14529 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
CUX2O14529 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
CUX2O14529 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
CUX2O14529 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
CUX2O14529 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
CUX2O14529 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
CUX2O14529 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
CUX2O14529 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
CUX2O14529 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
CUX2O14529 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
CUX2O14529 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CUX2O14529 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC46.04■■■■■ 4.96
CUX2O14529 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
CUX2O14529 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC46.02■■■■■ 4.96
CUX2O14529 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC45.99■■■■■ 4.95
CUX2O14529 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.98■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms