Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F3O00716 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F3O00716 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F3O00716 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
E2F3O00716 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
E2F3O00716 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F3O00716 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F3O00716 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
E2F3O00716 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F3O00716 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
E2F3O00716 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F3O00716 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F3O00716 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F3O00716 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
E2F3O00716 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
E2F3O00716 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F3O00716 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F3O00716 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
E2F3O00716 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F3O00716 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
E2F3O00716 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F3O00716 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F3O00716 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F3O00716 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
E2F3O00716 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
E2F3O00716 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F3O00716 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F3O00716 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
E2F3O00716 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F3O00716 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F3O00716 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F3O00716 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F3O00716 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
E2F3O00716 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F3O00716 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F3O00716 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F3O00716 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F3O00716 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F3O00716 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
E2F3O00716 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F3O00716 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
E2F3O00716 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F3O00716 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F3O00716 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
E2F3O00716 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F3O00716 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F3O00716 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
E2F3O00716 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F3O00716 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F3O00716 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F3O00716 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
E2F3O00716 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F3O00716 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F3O00716 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
E2F3O00716 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F3O00716 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
E2F3O00716 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F3O00716 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F3O00716 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F3O00716 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
E2F3O00716 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F3O00716 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F3O00716 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
E2F3O00716 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
E2F3O00716 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
E2F3O00716 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F3O00716 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
E2F3O00716 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F3O00716 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F3O00716 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
E2F3O00716 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F3O00716 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F3O00716 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
E2F3O00716 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F3O00716 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
E2F3O00716 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
E2F3O00716 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F3O00716 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
E2F3O00716 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F3O00716 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F3O00716 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F3O00716 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
E2F3O00716 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F3O00716 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
E2F3O00716 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F3O00716 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
E2F3O00716 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F3O00716 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F3O00716 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F3O00716 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
E2F3O00716 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F3O00716 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
E2F3O00716 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F3O00716 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F3O00716 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F3O00716 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
E2F3O00716 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F3O00716 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F3O00716 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
E2F3O00716 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms