Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP9YO00507 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP9YO00507 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP9YO00507 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP9YO00507 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP9YO00507 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP9YO00507 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP9YO00507 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP9YO00507 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP9YO00507 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP9YO00507 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP9YO00507 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP9YO00507 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
USP9YO00507 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
USP9YO00507 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP9YO00507 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
USP9YO00507 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP9YO00507 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
USP9YO00507 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP9YO00507 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
USP9YO00507 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP9YO00507 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
USP9YO00507 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
USP9YO00507 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
USP9YO00507 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP9YO00507 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP9YO00507 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
USP9YO00507 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP9YO00507 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP9YO00507 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP9YO00507 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP9YO00507 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
USP9YO00507 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
USP9YO00507 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP9YO00507 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
USP9YO00507 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP9YO00507 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP9YO00507 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP9YO00507 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
USP9YO00507 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP9YO00507 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
USP9YO00507 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
USP9YO00507 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
USP9YO00507 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP9YO00507 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
USP9YO00507 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP9YO00507 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
USP9YO00507 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
USP9YO00507 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP9YO00507 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP9YO00507 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP9YO00507 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP9YO00507 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP9YO00507 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP9YO00507 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP9YO00507 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP9YO00507 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP9YO00507 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP9YO00507 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP9YO00507 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP9YO00507 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP9YO00507 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
USP9YO00507 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP9YO00507 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
USP9YO00507 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP9YO00507 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP9YO00507 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
USP9YO00507 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP9YO00507 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP9YO00507 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP9YO00507 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
USP9YO00507 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
USP9YO00507 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
USP9YO00507 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9YO00507 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9YO00507 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9YO00507 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9YO00507 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
USP9YO00507 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
USP9YO00507 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP9YO00507 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP9YO00507 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP9YO00507 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
USP9YO00507 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP9YO00507 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP9YO00507 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
USP9YO00507 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9YO00507 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9YO00507 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9YO00507 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP9YO00507 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP9YO00507 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms