Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT5O00445 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SYT5O00445 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT5O00445 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT5O00445 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT5O00445 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT5O00445 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SYT5O00445 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT5O00445 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT5O00445 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SYT5O00445 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT5O00445 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT5O00445 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT5O00445 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SYT5O00445 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SYT5O00445 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SYT5O00445 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SYT5O00445 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT5O00445 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT5O00445 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SYT5O00445 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT5O00445 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SYT5O00445 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT5O00445 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT5O00445 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYT5O00445 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT5O00445 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT5O00445 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT5O00445 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYT5O00445 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYT5O00445 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT5O00445 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT5O00445 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYT5O00445 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT5O00445 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT5O00445 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT5O00445 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYT5O00445 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYT5O00445 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT5O00445 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT5O00445 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT5O00445 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYT5O00445 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT5O00445 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT5O00445 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT5O00445 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT5O00445 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYT5O00445 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYT5O00445 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT5O00445 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT5O00445 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT5O00445 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT5O00445 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT5O00445 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYT5O00445 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT5O00445 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT5O00445 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT5O00445 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYT5O00445 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT5O00445 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT5O00445 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT5O00445 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYT5O00445 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT5O00445 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT5O00445 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT5O00445 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT5O00445 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT5O00445 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT5O00445 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYT5O00445 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT5O00445 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT5O00445 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT5O00445 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYT5O00445 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT5O00445 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYT5O00445 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT5O00445 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SYT5O00445 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT5O00445 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT5O00445 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SYT5O00445 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT5O00445 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SYT5O00445 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT5O00445 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SYT5O00445 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT5O00445 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT5O00445 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT5O00445 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT5O00445 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SYT5O00445 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT5O00445 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT5O00445 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT5O00445 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT5O00445 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SYT5O00445 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT5O00445 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SYT5O00445 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT5O00445 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT5O00445 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SYT5O00445 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms