Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE2AO00408 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PDE2AO00408 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDE2AO00408 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PDE2AO00408 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PDE2AO00408 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PDE2AO00408 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PDE2AO00408 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE2AO00408 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE2AO00408 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE2AO00408 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PDE2AO00408 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE2AO00408 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PDE2AO00408 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE2AO00408 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PDE2AO00408 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PDE2AO00408 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms