Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UPK1AO00322 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UPK1AO00322 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPK1AO00322 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
UPK1AO00322 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UPK1AO00322 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms